代管系统品系命名规范

随着软件使用不断规范,为避免后期与他人品系造成混乱误认,现对软件命名做出如下规范:

一. 关于显示品系全称与简称问题

现不同学生要求不同,全部显示简称可能会导致信息显示不全,全部显示全称造成难以辨认。

建议:显示简称,品系名称可点击,点击后出现详情框,包括该品系特殊要求,注意事项等(如是否剪尾,剪尾长度,是否采血等),该品系繁殖笼,库存笼数目,超过多久未生崽。

二.关于品系名称大小写及格式规范问题

  1. 基因名称建议以NCBI官方名为主,常见基因可用通俗名称,大小写据其调整。

  1. 基因敲除用大写KO表示。

  1. 条件性基因敲除用大写CKO表示。

  1. 基因敲入用大写KI表示,条件性基因敲入用大写CKI表示。

  1. 转基因用Tg表示。

  1. 不同基因之间用;隔开,同一基因与插入元件之间用“-”注释。

三.同一实验室,相同品系多人共有

  1. 多人拥有相同品系,每人均需录入该品系信息及基因信息,名称后面加入姓名首字母大写,如Akt1-flox(CZ)。

  1. 当同一实验室多人姓名缩写相同时可在后面缀数字1-n,如Akt1-flox(CZ-1)。

四.关于品系内基因是都需要全部显示在命名中

  1. 小的插入元件如ires,P2A等,未对基因功能起明显作用的元件无需显示。

  1. 荧光标记可显示,统一用大写表示,如GFP,CFP,RFP,如tdTomato可采用常见标记方式。

  1. 品系内包含的重要基因务必显示,如OT2, MD4等,防止与其他品系互配造成遗漏影响实验。

示例如下:

类型 品系简称 品系简称(示例)
CKO 基因-flox Akt1-flox
KO 基因-KO Akt1-KO
KI 基因-插入位点或片段或大小 Akt1-KI
Cre/CreERT2 基因-Cre/CreERT2 Myh6-Cre或Myh-CreERT2
TG Tg(转基因位点/片段) Tg(APPswe;PSEN1dE9)
多基因,同类型(flox/cre) 基因1-flox;基因2-cre Akt1-flox;Myh6-cre